紅外線分析器的氣樣出口都是通大氣的，不論是何種，都必須注意保證使儀器獲得具有代表性的樣品。在分析煙道氣時，原始氣流又潮又熱，還可能有特殊物質，應該特別注意避免特殊物質冷凝、沉積在分析器的氣室窗口上。因此，儀器的使用應與取樣的技術結合起來。
取樣系統(tǒng)一般包括雜質過濾、干燥、壓力控制和流量控制等。對于高溫煙道氣還需有冷卻裝置。取樣系統(tǒng)的組成應視被監(jiān)測的環(huán)境、背景條件而定。取樣系統(tǒng)的有效性對儀器正常運行具有重要作用。任何灰塵或水氣在測量氣室中的沉積或冷凝都會給儀器零點穩(wěn)定性和測量精度帶來不良影響，甚至使儀器不能工作。因此，要定期清洗和更換取樣系統(tǒng)的有關部分，以維護取樣系統(tǒng)的清潔和有效性。
紅外線氣體分析器投入正常工作以后，每周至少要用標準氣樣校準刻度一次，以確保儀器分析的準確性。所用的標準氣樣可是標準混合氣制造部門提供的鋼瓶裝標準氣，也可以是臨時以動態(tài)法或靜態(tài)法制備的標準氣樣。標定分析器時，要先校正儀器的零點和終點。校正零點用的標準零點氣就是純氮。校正終點所用的終點氣應盡量接近儀器的滿量程標度。已知標準氣的精度比一儀器的精度高3倍，即標準氣的分析誤差不多過儀器測量誤差的三分之一。若零點和終點與標準樣品的特定值之間有較大偏差，則要在反復通入零點氣與滿量程標準氣情況下，反復調整儀器的靈敏度調節(jié)旋鈕，反復校正零點和終點，直到零點和終點的指示值符合要求為止。這是由于調節(jié)零點和終點相互關聯(lián)、相互影響。必要時，即不能達到滿量程時，也可以調整主放大器的放大器靈敏度調節(jié)旋鈕。
檢測器是儀器的主要部件之一，如果懷疑檢測器絕緣不好，可用萬用表或高阻計測試，不允許用搖表測試。檢測接收器上的接點，不能用烙鐵去熔錫，以防破壞內部密封。
儀器的光學系統(tǒng)要保持清潔，不能用手檫拭。如反射鏡被玷污，可以用長纖維棉花球蘸無水乙醇檫洗。接收器和氣室的窗口只能用高級光學鏡頭紙檫拭。測量氣室可用無水乙醇沖洗。
紅外光源燈絲的位置是調定的，不要隨意搐動。兩個燈絲是經老化后按形狀、電阻值和輻射光來選擇配對的，不得隨意更換。
儀器的轉動部分是切光器，它的馬達單向轉動，不得強行倒轉，以免造成損壞。對切光片的軸承可以定期加注潤滑油以維護其良好的轉動性能，儀表潤滑油以每半年加一次為宜。
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